En 1987, Albert Ondo Ossa passe le concours d’agrégation des facultés des sciences économiques et de gestion de Dakar (Sénégal). Il passe ensuite par l’ensemble des grades universitaires au sein de l’université Omar-Bongo pour devenir de 1988 à 1990 chef du département d’économie et ensuite en 1990 doyen de la faculté de droit et des sciences économiques. Il fonde en 1993, au sein de cette même université, le laboratoire d’économie appliquée (LEA) dont il est le directeur, et dont la revue paraît depuis 2013. En 1996 il obtient le grade de professeur titulaire.
Albert Ondo Ossa a à son compte de nombreuses contributions et/ou conduites de travaux dans la sous-région autour de questions de coordination de politiques budgétaires, politiques monétaires, et autres problématiques économiques, sociales et politiques.
En 2006, Albert Ondo Ossa rejoint le gouvernement, sous la direction du président Omar Bongo et du premier ministre Jean Eyeghe Ndong. Il est successivement ministre de l’Éducation nationale et de l’enseignement supérieur (2006), ministre de l’Enseignement supérieur et de la recherche (2007), ministre de la Recherche scientifique & du développement technologique (2008). Il est candidat à l’élection présidentielle de 2009, à la mort du président Omar Bongo Ondimba.